Die Handelskammer beider Basel besteht seit dem Zusammenschluss der Basler Handelskammer und dem Verband der Industriellen Baselland am 1.1.1997 als Verband der Unternehmungen aus dem Industrie- und Dienstleistungssektor in den Kantonen Basel-Stadt und Basel-Landschaft.
Die Basler Handelskammer wurde 1876 gegründet als Reaktion auf die Umwälzungen in Technik und Wirtschaft jener Zeit. Sie sollte der Konzentration staatlicher Kompetenzen beim Bund und den Kantonen durch eine organisierte wirtschaftliche Interessenvertretung entgegentreten.
Der Verband der Industriellen Baselland wurde 1919 gegründet als Reaktion auf die schlechte wirtschaftliche Situation am Ende des Ersten Weltkriegs und die damals bestehenden sozialpolitischen Probleme.
In ihrem Leitbild aus dem Jahr 2000 definiert sich die Handelskammer beider Basel als Interessenvertreter ihrer Mitglieder gegenüber Staat, Parteien und Öffentlichkeit sowie als Dienstleistungsbetrieb für ihre Mitglieder. Sie hat ihre Aktivitäten in eine wirtschaftspolitische Abteilung und eine Dienstleistungsabteilung gegliedert.